肇庆医学高等专科学校建校于1958年，前身为中山医学院肇庆分院，2004年经教育部批准正式升格为肇庆医学高等专科学校。
学校是由肇庆市人民政府举办的全日制公办普通高等专科学校，实行“省市共建，以市为主”的管理体制，业务主管部门为广东省教育厅。广东省人民政府和肇庆市人民政府对学校发展给予办学条件、经费和政策等方面的支持。
肇庆医学高等专科学校秉承“育人为本、质量立校、人才强校、特色兴校”的办学理念，主动适应地方经济社会发展需要，以服务为宗旨，以就业为导向，以职业能力培养为本位，走“校院合作、医教结合”的发展道路；学校坚持育人为本，德育为先，把人文医学教育贯彻于整个教学始终；专业实践教学与医疗工作岗位需求紧密对接，形成了鲜明的卫生职业教育特色，已成为广东省广大基层卫生行业高素质技能型专业人才培养基地；在职卫生人员继续教育培训基地；卫生行业先进医护技术吸收、消化、转移和创新基地；社会医疗服务重要力量。
学校大力实施校院（企）合作办学、协同育人、共同发展，构建多元化办学格局和人才培养体系，为基层培养高素质应用型卫生人才，努力创建服务基层卫生行业的高质量医学应用型大学。
肇庆医学高等专科学校的办学定位是“立足广东、辐射全国、面向基层、服务社会”，本着“德为先、强基础、重技能、高素质”的人才培养宗旨，注重提高质量，努力办出特色，为农村、基层培养专科层次“下得去、用得上、留得住”的高素质应用技能型医药卫生人才。
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